补偿器的波纹管主要起到以下作用：

1. 吸收位移变形：波纹管补偿器是一种利用其自身弹性变形功能来补偿管道由于热变形、机械变形和各种机械振动产生的轴向、角向、侧向及其组合位移的装置。波纹管作为其主要弹性元件，通过自身的伸缩和弯曲，可以有效地吸收这些位移变形，从而起到保护管道的作用。

2. 降噪减振：波纹管补偿器还具有良好的减振降噪功能，能够吸收设备振动，减少设备振动对管道的影响，提高管道的使用寿命。

3. 耐压、密封、耐腐蚀：波纹管补偿器还具有耐压、密封、耐腐蚀等特性，能够应对复杂的工作环境，保证管道的安全稳定运行。

综上所述，补偿器的波纹管在管道系统中起到了关键的补偿、减振、降噪以及耐压、密封、耐腐蚀等作用，对于确保管道系统的安全、稳定运行具有重要意义。